- Une combinaison haplotypique est une combinaison allélique à plusieurs locus.
- Le développement de technologies générant des données biologiques à haut débit a été possible grâceà la diminution des coûts de séquençage.
- Au même titre que pour la PCR, une réaction de séquence nécessite les deux amorces pour délimiterle fragment à séquencer.
- La génomique de recherche permet de faire émerger sans aucun à priori de nouvelles hypothèses derecherche.
- Pour les séquences d'acides aminés issues d'un séquencage direct de protéines, la séquence denucléotides correspondante est obtenue grâce à l'utilisation d'un programme informatiqueautomatique.
- La population respectant le loi d'HW a ses fréquences alléliques inchangées et ses fréquencesgénotypiques stabilisées après une génération.
- Le code génétique est dégénéré car il existe plusieurs combinaisons de trois lettres pour coder le mêmeacide aminé.
- Un QTL est un marqueur qui est toujours homozygote.
- Soit un individu qui a les génotypes G/C au locus 1, A/G au locus 2 et G/G au locus 3, le nombred'haplotypes qui alors le caractérise à ces deux loci est de 4.
- Une population est caractérisée par les allèles G et C au locus 1 et A et G au locus 2. Le nombred'haplotypes qu'a théoriquement cette population est 8.
- Après 6 cycles de PCR, le nombre de molécules d'ADN double brin est de 36.
- La recherche de QTL nécessite d'avoir une population variable pour le caractère d'intérêt et une cartegénétique constituée de nombreux marqueurs, facilement « génotypables » et bien répartis dans legénome de l'espèce.
- Le maintien d'un déséquilibre de liaison entre des marqueurs et un phénotype au cours des générationsest fonction de la mutation du phénotype.
- La méthylation de l'ADN affecte exclusivement des nucléotides de type G.
- Lorsque deux marqueurs sont en déséquilibre de liaison, cela signifie qu'ils ne sont pas localisés à côtéd'un QTL.
- Les ARN longs non codants sont peu nombreux dans les génomes des eucaryotes supérieurs parrapport aux ARN codant des protéines.
- Le RNA-seq et l'hybridation sur « puce à gènes » sont des méthodologies permettant de quantifiersimultanément des dizaines de milliers de gènes (l'ensemble des gènes connus) dans un tissu et unindividu donné.
- Pour le gène TAS2R38, 3 mutations ont été décrites (nucléotide 145, 785, 886 à partir de l'ATG). Sipour un individu, l'haplotype observé est AP/AA/VV, il existe plusieurs combinaisons haplotypiquespossibles.
- Le microbiome fait référence à la description et quantification par séquencage des microorganismesd'un échantillon qui peut être de nature variée (sol, échantillon biologique comme un segment del'intestin ...).
- Le nombre de transcrits codant une protéine dans le génome des eucaryotes supérieurs est de l'ordrede 20 000.