- Les réactifs nécessaires pour une amplification d'ADN par PCR sont : le tampon de l'enzyme, duMgCl2, les dNTPs, les 2 amorces sens et antisens, la Taq polymerase et l'ADN.
- L'alignement par la méthode « matrice de points » est basé sur le calcul d'une matrice pour laquelletous les scores de comparaison entre chaque résidus sont inclus.
- Lors de la préparation d'ADN, les billes de Chelex sont ajoutées dans le mix PCR pour inhiber lesDNAses.
- Les puces à gènes permettent d'explorer les processus biologiques impactés par deux conditions,comme par exemple, deux régimes alimentaires.
- Un alignement de séquence utilise les mêmes coûts pour les « gaps » et pour les mésappariements.
- Les méthodes d'alignement de séquence basées sur la programmation dynamique ne garantissent pasl'obtention du meilleur résultat, mais sont les plus rapides.
- Le développement de technologies générant des données biologiques à hauts débit a été possible grâceà la diminution des coûts de séquençage.
- A condition de choisir correctement ses amorces, il est possible d'amplifier et de séquencer la partienon codante d'un gène.
- Au même titre que les puces à ADN, le séquencage du génome permet de quantifier le niveaud'expression des gènes.
- Pour réaliser une réaction de séquence de type Sanger, il est nécessaire de fournir deux amorces(primers) pour initier la polymérisation de l'ADN.
- La PCR est une technique d'amplification de l'ADN in vivo.
- L'action de la Taq polymérase est cation dépendante. C'est pourquoi on ajoute du MgCl2 dans lesréactions de PCR.
- Contrairement au RNA-seq, la méthodologie d'hybridation sur « puce à gènes » permet de découvrirde nouveaux gènes et de nouveaux transcrits.
- Les extrémités d'un amplicon (fragment d'ADN amplifié par PCR) correspondent aux deux amorcesutilisées lors de la réaction de PCR.
- Lors d'une réaction de séquence dans un tube, on utilise simultanément les deux amorces du gène oude la région chromosomique ayant permis son amplification.
- Si, lors d'une réaction de séquence, un ratio dntp/ddntp de 300:1 permet de séquencer des fragmentsd'environ 800 bp, alors, le simple fait de passer ce ratio à 600:1 permettra de séquencer des fragmentsd'environ 1600 bp.
- Pendant une électrophorèse, les fragments d'acides nucléiques (-) migrent vers l'anode (+).
- La taille des séquences générées par séquencage Sanger est potentiellement illimitée.
- Le maintien d'un déséquilibre de liaison entre deux marqueurs au cours des générations est fonctionde la distance entre ces marqueurs.
- « Brin codant » et « Brin sens » sont deux termes désignant la partie codante d'un gène. FAUX